Chrome хранит закладки в базе данных файла. Этот файл называется "Bookmarks" и находится в папке профиля пользователя Chrome. Путь к этой папке зависит от операционной системы. На Windows путь будет выглядеть так: C:Users[username]AppDataLocalGoogleChromeUser DataDefault. На Mac OS X путь будет выглядеть так: ~/Library/Application Support/Google/Chrome/Default. На Linux путь будет выглядеть так: ~/.config/google-chrome/Default. В папке Default вы найдете файл Bookmarks.