Thunderbird хранит письма в файлах базы данных, именуемых «массивами». Каждый массив содержит информацию об одном аккаунте почты. Массивы находятся в папке «Профиль Thunderbird» пользователя, которая обычно находится в папке «Документы» или «Мои документы». Файлы массивов имеют расширение «.msf». Каждый массив содержит несколько файлов, именуемых «файлами данных». Файлы данных имеют расширение «.msf» и хранят информацию о письмах.